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OGT关注针对小型NGS癌症产品,计划推出基于阵列的ce-ivd NIPT

编辑:   上传日期:2015-08-13  阅读次数:

上周,位于英国的Oxfordshire分子遗传学企业退出了一款卵巢癌产品和一个试剂盒,企业的研究和开发副总裁John Anson表示,这将是一系列基于NGS的产品的第一种。

“这将会进入一个更具有针对性和特定疾病的领域,”Anson在采访中这样表示。

去年,企业推出了一款针对60个实体瘤基因的面板,这款产品是与南安普顿大学,伯明翰大学以及英国分层卫生保健计划的一部分CIS医学联合开发的。虽然这个产品包含了范围广泛的实体瘤相关基因,但是Anson表示,现在企业将关注更小范围,更特异的产品。
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例如,卵巢癌的产品奖仅仅靶向7个基因-BRCA1,BRCA2,TP53,PTEN,ATM,ATR和NF1。企业计划研究针对不同实体瘤及血液癌症的靶向产品,并且已经提供了一个25基因的骨髓产品。然而,在未来,Anson说,企业还将研发针对特定血液疾病的更小的产品。

他表示,企业现在将NGS产品定位在为转化研究客户,像医院和学术机构的大型癌症研究所,这些机构会使用这些产品来确定预后标记,这些标记能够告知新葡京在线反应和新的新葡京在线靶标
“大家想将研究与新的潜在疗法联系在一起,”他说。

Anson补充说,该企业还将于客户合作,设计一些癌症产品,以确保包括相关基因。

NGS癌症产品市场竞争尤为激烈。主要的NGS企业-Illumina和Thermo Fisher Scientific-占有大部分癌症产品市场,安捷伦和RainDance Technologies也做样品处理,并且许多学术研究机构也自己研发相关产品。

尽管如此,Anson表示,OGT擅长于诱饵设计,这将帮助与对手竞争。“大家做诱饵设计有经验化优势,”他说。“而不仅仅是依赖于不公可用的App。”此外,该企业还是用自己的App在后台进行分析。
虽然OGT是一家以芯片而出名的企业,但是其现在已经运行了超过6000分NGS样品。

OGT研发部主任GrahamSpeight表示,企业也将通过整个靶向区域提供其维持机制的产品,甚至包括整个覆盖区域,这对于某些体细胞的突变十分重要,因为在卵巢癌的产品中,小等位基因的频率可以低于1%。此外,对于一些肿瘤抑制基因,例如在卵巢癌的产品中,覆盖整个基因是至关重要的,因为通过整个基因的检测,可以发现突变基因,虽然突变往往是集中在突变热点区域的。“你需要覆盖每个外显子的碱基,这样才能得到你需要的灵敏性,”他说。

此外,Anson说,OGT也将提供配套产品。去年,其收购了位于伦敦的基于荧光原位杂交的Cytocell企业。Anson表示,Cytocell荧光原位杂交产品以及OGT的独有的细胞遗传学产品是一个良好的补充。“使用该技术来看拷贝数变异和用于SNVs的NGS之间具有一个良好的交叉作用,”Anson说。

虽然该企业最初关注的是临床和转化研究市场,但是其所有的NGS产品仅仅用于研究市场,Anson表示企业现在讲着眼临床市场。

“如果这些检测被发现对于诊断室重要的,大家将准备走管理路线,”Anson说。“大家已经使用大家的FISH产品完成了一些,并且大家正在努力朝监管方向努力。”

Anson预计,癌症产品可能会逐渐接近,甚至被机关机构批准,当然是指那些关注在临床前工作中发现,对于治疗,诊断和预后具有相关性的基因或者特定突变。

除了癌症,该企业还在研发美国宪法允许的产品,并且打算进入到无创产前检测市场。

在年底之前,OGT计划一个叫做CE-IVD的NIPT申请给欧洲监管局,并希翼能够2016年启动该测试。目前,企业正在进行临床检测试验,这项产品奖主要使用微阵列技术来筛查唐氏综合症。

Anson说,企业决定基于阵列平台,而不是NGS的NIPT,这是因为其可以有一个更快的周转时间和潜在的更低的成本。微阵列NIPT的周转时间可以在三天内轻松完成。目前,NIPT企业提供的基于NGS的检测,测试的周转时间大概是7-10天。

与其他的产品相类似,OGT计划将NIPT做成一个试剂盒,而不是检测服务。

OGT也提供基于阵列的胚胎移植前的基因筛查检测,Anson表示,在可预见的未来,该企业不会转化成基于NGS的技术。

该企业还将关注基于阵列的用于宪法允许的疾病的研究,然而,Anson表示,基于NGS的产品卡可以补充OGT市场上的基于阵列的产品。当前,企业市场主要是医学研究的外显子阵列,这是由Emory遗传学实验室结合设计的。

这个阵列含有增强的4600个与医疗研究相关的基因,并且这些基因已经根据特异性症状进行了分组。OGT设计其主要是用来与外显子测序互补的,EGL对冲基金实行主任Madhuri Hegde表示,OGT的阵列和EGL独有的医疗外显子检测联合,可以有更好地针对缺失和增多的更好效果。

OGT也将关注一些列其他遗传疾病的阵列研究,包括自闭症,杜氏肌萎缩症,癫痫,智力障碍,听力丧失和代谢紊乱等。

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